Fiscalité

Expert-Comptable Innovation : CIR, CII & JEI

Sécurisez vos aides à l'innovation. Hayot Expertise vous accompagne sur le Crédit d'Impôt Recherche (CIR), CII et l'obtention du statut JEI à Paris.

Need expert support?

Book a discovery meeting at our office

01 48 48 24 14

Financez votre Innovation : CIR, CII et Statut JEI

Sécurisez vos crédits d'impôt

La R&D est le moteur de votre startup ou PME innovante. Ne passez pas à côté des dispositifs fiscaux français exceptionnels pour financer votre croissance. Toutefois, face à la complexité administrative, le recours à un cabinet d'expertise comptable spécialisé est impératif pour sécuriser vos avantages.

Les dispositifs d'aide à l'innovation décryptés

  • Le Crédit d'Impôt Recherche (CIR) : Permet de récupérer jusqu'à 30% des dépenses éligibles liées à la R&D (personnel chercheurs, dotations aux amortissements, sous-traitance agréée, veille technologique). Un levier de financement non dilutif majeur pour tout projet de recherche fondamentale, appliquée ou développement expérimental.
  • Le Crédit d'Impôt Innovation (CII) : Permet de récupérer jusqu'à 20% des dépenses éligibles liées à la conception de prototypes innovants. Plafond de dépenses maintenu à 400 000€/an, soit un crédit maximal de 80 000€. Réservé aux PME au sens communautaire (< 250 salariés, CA < 50M€).
  • Le statut de Jeune Entreprise Innovante (JEI) & JEII/JEIC : Réservé aux entreprises de moins de 8 ans investissant massivement en R&D (> 15% des charges totales), ce statut offre des exonérations de charges sociales patronales sur les personnels de R&D, ainsi que d'importants allégements fiscaux (exonération IS 1ère année bénéficiaire, exonération CFE et taxe foncière).

Les dépenses éligibles au CIR

Personnel de R&D (poste principal)

  • Rémunérations et charges sociales des chercheurs et techniciens de recherche
  • Rémunération du dirigeant si directement impliqué dans les travaux de R&D (plafonné)
  • Intérim et CDD affectés à des projets R&D

Amortissements et frais de fonctionnement

  • Amortissement des équipements utilisés pour la R&D (ordinateurs, serveurs, appareils de mesure)
  • Frais de fonctionnement : forfait de 43% des dépenses de personnel (simplification administrative)

Sous-traitance

  • Sous-traitance à des organismes de recherche agréés (laboratoires, universités, start-ups R&D certifiées)
  • Plafond : 2× le montant des dépenses propres pour la sous-traitance publique

Autres dépenses

  • Brevets : acquisition, dépôt, maintenance
  • Veille technologique : jusqu'à 60 000€/an
  • Participation à des salons et conférences scientifiques

Les exonérations JEI/JEII en détail

ExonérationJEI (Jeune Entreprise Innovante)JEII (Jeune Ent. de Croissance)
Condition R&D> 15% des charges> 5% des charges
Exonération charges patronales100% sur salaires R&D100% sur salaires R&D
Plafond salaire exonéré4,5 SMIC/mois par personne4,5 SMIC/mois par personne
Exonération IS1ère année bénéficiaire1ère année bénéficiaire
CFE / Taxe foncièreExonération possible (vote communes)Exonération possible
DuréeJusqu'aux 8 ans de la sociétéJusqu'aux 8 ans

Un accompagnement total : de l'audit au contrôle fiscal

Étude d'éligibilité de vos projets Tech

Avant toute démarche, nous évaluons la viabilité de vos projets au regard du Manuel de Frascati et de la doctrine fiscale. Toutes les dépenses informatiques ne sont pas de la R&D : nous distinguons le développement classique (non éligible) du développement expérimental éligible.

Rédaction du rescrit fiscal et dossier justificatif

En collaboration étroite avec nos ingénieurs partenaires, nous constituons les dossiers techniques (état de l'art, démarche scientifique, verrous technologiques) et financiers pour bétonner votre CIR/CII. Le "Rescrit" permet d'obtenir la validation préalable de l'administration avant de déposer votre déclaration.

Sécurisation comptable et assistance en cas de contrôle

Nous isolons l'analytique R&D dans votre comptabilité (codes projets, affectation du temps par employé, suivi des dépenses éligibles). En cas de vérification de comptabilité ou de contrôle du Ministère de la Recherche (double contrôle possible), nous sommes physiquement à vos côtés pour défendre le dossier.

La procédure de demande de CIR

  1. Identification des projets R&D éligibles (avec votre équipe technique)
  2. Collecte et qualification des dépenses (fiches de temps, factures, contrats)
  3. Rédaction du rapport technique (état de l'art, description des verrous)
  4. Déclaration du CIR (formulaire 2069-A-SD joint à la liasse fiscale)
  5. Restitution ou imputation : le CIR est imputé sur l'IS dû ; s'il est supérieur, le solde est remboursé par l'État (remboursement immédiat pour les startups < 3 ans ou en perte)

Les risques d'un CIR mal ficelé

Un redressement avec pénalités peut être fatal pour la trésorerie d'une startup. Les redressements CIR représentent en moyenne 40 à 60% des montants déclarés lorsque le dossier justificatif est insuffisant. Nous agissons comme une véritable barrière de protection entre l'administration fiscale et votre innovation.

Points de vigilance majeurs :

  • Absence de documentation sur les "verrous technologiques"
  • Confusion entre développement classique et R&D éligible
  • Absence de fiches de temps par projet et par employé
  • Sous-traitance non agréée déclarée comme éligible

FAQ - Questions fréquentes

Peut-on bénéficier du CIR et du CII simultanément ? Oui, mais pour des projets distincts. Le CIR s'applique à la recherche fondamentale et au développement expérimental. Le CII s'applique à la conception de prototypes de produits nouveaux. Un même projet ne peut pas bénéficier des deux dispositifs.

Le statut JEI est-il compatible avec le CIR ? Oui, et c'est même le cumul idéal pour une startup innovante. Le CIR crédite les dépenses R&D, le JEI exonère les charges patronales sur les salaires de R&D. Les deux dispositifs sont parfaitement cumulables.

Comment obtenir le remboursement anticipé du CIR ? Les entreprises de moins de 3 ans, les PME en déficit et les entreprises en difficultés peuvent obtenir le remboursement immédiat du CIR. Pour les autres, le CIR est imputable sur l'IS des 3 exercices suivants, puis remboursé en numéraire si non imputé.

Quel est le délai de prescription pour un contrôle CIR ? L'administration peut contrôler votre CIR pendant 3 ans après sa déclaration (droit général de reprise). Un double contrôle par le Ministère de la Recherche peut intervenir dans le même délai. Il est impératif de conserver tous les justificatifs pendant 10 ans minimum.

📞 Préqualifiez votre entreprise pour le statut JEI ou le CIR - Prenez RDV

Voir aussi : Financement entreprise : solutions 2026 | Loi de finances 2026 : mesures clés pour les PME

Quick and clear quote

Response within 24h • Confidential

By submitting, you agree to our privacy policy.